Почему нейросеть AlphaFold от Google наделала столько шума? Как компьютерное моделирование белков помогает создавать лекарства от ВИЧ и антидоты от «Новичка»? Что такое ДНК-оригами и когда мы сможем использовать его для адресной доставки лекарств? Говорим с сотрудником факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ Артуром Залевским о структурной биоинформатике и ее роли в медицине.
Темы выпуска:
00:00 — Знакомство с Артуром
03:21 — Проблема сворачивания белка
08:09 — Методы определения структуры белка
13:18 — Google присоединяется к решению задачи
21:33 — Взаимодействие команды DeepMind с научным сообществом
26:09 — Координация экспериментов и моделирования
33:23 — Роль AlphaFold в науке и медицине
35:39 — Исследования Артура про ВИЧ и антидоты для химического оружия
41:39 — ДНК-оригами для экспериментов и доставки лекарств
45:37 — Какие факторы сворачивания белка мы можем учесть при моделировании
Выпуск записывался в середине декабря 2020 года, по горячим следам от релиза AlphaFold.
Cсылки из выпуска:
- Игра FoldIt для предсказания структуры белков https://fold.it/
- Статья на Медузе «Фундаментальная «проблема белка» решена» https://meduza.io/feature/2020/12/13/fundamentalnaya-problema-belka-reshena-uchenye-bilis-nad-ney-polveka-no-vse-sdelali-programmisty-google-i-eto-mozhet-byt-ochen-vazhno-dlya-meditsiny
- Статья про AlphaFold на Биомолекуле https://biomolecula.ru/articles/alphafold-neiroset-dlia-predskazaniia-struktury-belkov-ot-britanskikh-uchenykh
- Пост Мохамеда аль Карайши https://moalquraishi.wordpress.com/2020/12/08/alphafold2-casp14-it-feels-like-ones-child-has-left-home/
- Статьи Артура про ВИЧ-интегразу https://www.nature.com/articles/s41598-017-05659-5 (2017), https://www.mdpi.com/2218-273X/10/9/1236 (2020)
Голоса выпуска:
Артур https://www.facebook.com/ArthurZalevsky
Илья https://www.instagram.com/ilya.smolensky/
Андрей https://vk.com/special.linear
Кирилл https://www.instagram.com/batalkin/
Приходите комментировать и общаться к нам в Telegram — https://t.me/observereffect
Контакты:
- Пишите нам на hello@observereffect.ru
- Telegram https://t.me/observereffect
- Instagram https://instagram.com/observereffect.ru